SEMI OpenIR  > 集成光电子学国家重点实验室
应用BIGIS-4测序系统完成Glaciecola mesophila sp.nov.的全基因组测序和组装
袁丽娜; 任鲁风; 李运涛; 韩伟静; 俞勇; 楚亚男; 刘贵明; 于丹; 滕明静; 王亮; 王绪敏; 周晓光; 俞育德; 于军
2011
Source Publication中国科学. 生命科学
Volume41Issue:7Pages:544-549
AbstractBIGIS-4是中国新一代基于焦磷酸测序技术的测序仪.本实验利用BIGIS-4完成了对Glacielola mesophila sp.nov.(Gmn)的全基因组测序.Gmn是一株从海洋无脊椎动物体内分离到的革兰氏阴性菌.BIGIS-4测序得到152043个高质量的测序片段,平均读长406bp.测序片段由BIGIS-4系统后处理模块组装.除单核苷酸同聚体引起的测序错误外,测序结果中没有检测到其他低质量错误.Gmn基因组全长5144318bp,共注释得到4303个基因,其中有大量的代谢基因,与菌种在海洋表面非脊椎动物的生长环境相关.Gmn的冷适应和信号转导相关基因为其对海洋低温环境的适应提供了依据.
metadata_83集成光电子学国家重点实验室
Subject Area光电子学
Funding Organization中国科学院科研装备研制项目,国家自然科学基金,中国科学院北京基因组研究所自主立项经费资助
Indexed ByCSCD
Language中文
CSCD IDCSCD:4268495
Date Available2012-07-17
Citation statistics
Cited Times:1[CSCD]   [CSCD Record]
Document Type期刊论文
Identifierhttp://ir.semi.ac.cn/handle/172111/23282
Collection集成光电子学国家重点实验室
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GB/T 7714
袁丽娜,任鲁风,李运涛,等. 应用BIGIS-4测序系统完成Glaciecola mesophila sp.nov.的全基因组测序和组装[J]. 中国科学. 生命科学,2011,41(7):544-549.
APA 袁丽娜.,任鲁风.,李运涛.,韩伟静.,俞勇.,...&于军.(2011).应用BIGIS-4测序系统完成Glaciecola mesophila sp.nov.的全基因组测序和组装.中国科学. 生命科学,41(7),544-549.
MLA 袁丽娜,et al."应用BIGIS-4测序系统完成Glaciecola mesophila sp.nov.的全基因组测序和组装".中国科学. 生命科学 41.7(2011):544-549.
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